Eberhard Morgenroth ist Professor für Verfahrenstechnik in der Siedlungswasserwirtschaft mit Berufungen an die ETH Zürich und an die Eawag. An der Eawag ist er Leiter der Abteilung Verfahrenstechnik. Seine Forschungsinteressen umfassen Abwasserreinigung, Membranbioreaktoren zur Wasserwiederverwendung, Kontrolle von Biofilmen, Biofilmreaktoren, biologische Trinkwasseraufbereitung, dezentrale Abwasserbehandlung und Energierückgewinnung aus Abwasser und organischen Reststoffen. Er ist Redakteur für Wasserforschung und für Wasserwissenschaft und -technologie.
Eberhard Morgenroth hat einen MS (University of California 1994), einen Dipl.-Ing. (Technische Universität Hamburg-Harburg 1995) und einen Doktortitel (Technische Universität München 1998), alle in Bau- und Umwelttechnik. Nach einer zweijährigen Postdoktorandenzeit an der Technischen Universität Dänemark war er Professor an der University of Illinois at Urbana-Champaign (2000 bis 2009).